Ola
Existem alguns virus que deletam executacveis de programas como também executaveis do sistema operacional, provavelmente este virus deletou varios destes arquivos, sugiro a vc que faça uma formatação no computador, já que este caso e dificil de ser resolvido sem formatar. Aconselho também que se puder fazer uma formatcao sem passar dados de volta para o computador, sendo que as vezes passando os dados o vírus volta novamente.
Boa sorte.