Olá,
O IP do alias intranet faz parte da sua rede interna? No ISA nas configurações de webproxy no Network Object Internal você marcou a opção para bypassar os sites dentro da sua rede interna?
Se você olhar nos logs do ISA o que aparece quando você tentar acessar esse endereço?
Você pode ir no IIS (caso seja esse o seu webserver) tentar acessar diretamente esse site para ver se o problema pode ser outro.