Bom dia,
Pelo que entendi, tu tens uma placa para VPN e outra para acesso interno e internet, correto?
Quando as máquinas forem sair para a internet, elas irão para o roteador, quando forem para a VPN, irão pelo servidor.
Como tu tens 3 "redes", por assim dizer, te aconselho a colocar mais uma rede no teu servidor, para que ele faça o roteamento de toda a rede. Ou então utilizar uma appliance com essa capacidade, assim tu poderá fazer a VPN e a saída de internet
por essa appliance, a Cisco tem os RV-082, que tem um preço acessivel e é simples de configurar.
Caso não queira fazer isso, tu precisará deixar ou teu servidor ou teu router como Gateway padrão e criar rotas para o outro destino, o que irá gerar bastante trabalho pra ti.
No servidor, pode configurar o RRAS para fazer o roteamento.
Att,
Jonathan Schirmer