Felipecm, infelizmente quando se usa o desisntalador que vem juntamente com o programa em algumas máquinas ou até mesmo na tentativa de facilicar a sua reinstalação do mesmo os programadores optaram em não remover a ou as pastas do programa por completo. E as vezes esse comportamento acontece, o ideal é o sistema lhe avisar se você quer ou não remover TODOS os dados ou então no mínimo lhe avisar que tal pasta não é removida e se você quiser remover após a desinstalação do sistema deverá remover manualmente, porém nem sempre isso acontece.
Agora se a desisntalação ocorreu corretamente você pode apagar essa pasta com segurança.
Esperamos que ajude e se ajudar favor classificar.
Espere no Senhor, confia Nele,e o mais Ele fará