Oi,
Nesse caso você pode usar o OSQL com o parâmetro -i. Ex:
OSQL -S MeuServidor -U Usuario -P Senha -i C:\Arquivos\script.sql
Se quiser usar o seu usuário do AD tenta:
OSQL -S MeuServidor -E -i C:\Arquivos\script.sql
Coloca em um BAT todas as instruções OSQL e roda o bat
Falows