João,
Dá uma conferida com este aplicativo:
http://www.nirsoft.net/utils/what_run_in_startup.html (no final da página tem o download para 32 e 34bits).
Se for o caso, desabilita e reabilita, ou em último caso criar a chamada de novo, para que force a gravação no registro.
Atenciosamente,
Edinaldo Oliveira
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