Eduardo, você também pode criar um script de instalação para este seu Software e distribuir via GPO, é só deixar este software em um compartilhamento na rede com acesso para todos e deixar ele executar, para evitar instalar todas as vezes você pode colocar uma condição para abortar caso já esteja instalado, faço isso sempre, qualquer dúvida posta aqui.
No link abaixo temos um site muito bom que mostra as linhas de comando para a instalação de muitos Softwares:
http://www.appdeploy.com
Grande abraço
Welington Lima
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