Não conheço uma maneira para alterar isso por default, voce pode criar algum script powershell que desabilite o OWA para os usuário criados.
Set-CasMailbox <mailbox> -OwaEnable $false
Voce quer desabilitar o OWA completamente na organização ou é só pra alguns usuários?
Diego Wachholz - MCSA/MCTS - Microsoft Exchange Server 2007