Newton,
O melhor é criar/editar uma GPO com script de logon.
Na GPO vá em:
Configuração do usuário -> Configurações do windows -> Scripts (logon/logoff) -> Fazer logon, e adicione a sua bat.
Básico: Os usuários que precisam da bat devem estar em uma OU que esteja no "raio de ação" da GPO.
Agora se você quer mesmo copiar o arquivo para as estações vc então tem que fazer o mesmo procedimento acima mas com uma bat que copia a sua bat.(copy "\\serserver\seushare\suabat.bat" "C:\Documents and Settings\%username%\Menu Iniciar\Programas\Inicializar"
Se for para todos os usuários vc pode copiar a partir de sua estação para todas as outras, assim:
1-Tenha um arquivo com o nome de todas as estações(um nome por linha)- estacoes.txt.
2-Copie sua bat para todos as pastas "All users", abra um prompt e digite
FOR /F %H IN (estacoes.txt) DO copy "\\serserver\seushare\suabat.bat" "\\%H\c$\Documents and Settings\All Users\Menu Iniciar\Programas\Inicializar"
Vc deve ser administrador das estações para que a copia funcione.