Ola Marcos,
Desculpe mas sua duvida nao esta clara, o que tu queres migrar, o Exchange Server certo ?
Qual a tua atual versao, e qual a versao que deseja instalar ?
Para migrar ao Exchange 2016 é necessario possuir no minimo o Exchange 2010 SP3 – com o Rollup 11 instalado – e haver um nivel funcional de floresta pelo menos 2008 (Recomendado 2008R2 no minimo, ja que do CU7 em diante o requisito é 2008R2).
Quanto a tua duvida de começar do zero, eu sugiro que tu estudes um pouco como funciona um processo de migraçao. Nao é possivel instalar um novo Exchange por cima de um velho (In-place Upgrade), o procedimento é sempre criar uma infraestrutura
nova, e migrar as mailboxes da infraestrutura velha a nova.
Sendo honesto contigo, nao é algo facil e exige atençao. Se nao tens conhecimento sobre Exchange Server, sugiro que estude bastante antes de iniciar esse tipo de migraçao, pois qualquer detalhe pode parar teu ambiente. Aqui tem um
guia pratico de como migrar do Exchange Server 2010 ao Exchange Server 2016.
Abraços.
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