Marcelo..
Se você fizer isso só vai piorar a situação, pois além de continuar com um único servidor de AD, você vai arrumar uma baita confusão no AD.
Ao recuperar o system state, ele ira "clonar" o servidor em tudo, ex: os 2 servidores terao o mesmo nome... IP e assim por diante.
Atencisamente,
Jonathan