Olá Fábio,
É sempre bom utilizar os termos corretos. Dessa forma, ao invés de falarmos "o Enterprise Manager do SQL Server 2005", podemos simplesmente dizer o SQL Server Management Studio. Isso é importante para não gerar confusões e recomendações incorretas.
O Service Pack 2 não é o mesmo para todos. Normalmente há uma distinção entre produtos e plataformas. Há o Service Pack 2 para SQL Server 2005 x86 (32bits) ou x64 e IA64 (64bits). A única exceção é o SQL Server Express cujo o Service Pack já inclui o instalador.
Se você instalou o Service Pack 2 no SQL Server 2005, durante a instalação ele pergunta quais componentes você deseja atualizar (Database Engine, SSIS, Reporting Services, etc). Se você posteriormente reinstalar algum componente ou desinstalar e instalar de novo, o mesmo estará sem o Service Pack.
Há diferença de versões porque as ferramentas devem estar com o SP2 aplicado e o Reporting Services não. Instale novamente o Service Pack 2 e certifique-se de atualizar todos os componentes.
[ ]s,
Gustavo