Ola Glaucio,
Chegaste a ler o histórico ou documentaçao do produto?
If you have any domain controllers that are running Windows 2000 Server and you are using the Exchange 2007 RTM Setup.com, you must run each of the steps below with the /DomainController parameter to specify a domain controller that is running Windows Server 2003 SP1. If you are using Setup.com from Exchange 2007 SP1, you do not have to specify a domain controller that is running Windows Server 2003 SP1.
Ou seja, se tiver rodando SP1 tu pode especificar na interface grafica e fora isto se ele tiver em outro site ele nem vai pegar automatico se os sites do AD estiverem configurados corretamente, entao pode ir tranquilo.