Olá, acredito que não há como você realizar merge de um AVHD órfão, pois seria como montar um quebra-cabeça faltando peças, pois se tratam de discos diferenciais.
Mas como já vi de tudo, quem sabe. Quanto a questão de SNAPSHOT, sim, pois o SNAPHOST trata-se de uma cópia da virtualização e não de discos. então o Hyper-V irá restaurar o estado da VM, incluindo os discos.
Espero ter ajudado.