Customiza um relatório já existente de softwares instalados no cliente, e coloca na query um "where" onde a condição seja "not like" os seus software padrão.
Por exemplo, pega um relatório já pronto que liste todos os softwares instalado em uma estação e neste relatório cutomize a query para não te mostrar todos os sofrwares cujo o nome seja "Office, Antivirus e Project" (estes seriam seus softwares padrão e então o relatório só vai te mostrar os software que não fazem parte do padrão de sua imagem.
Porem tudo isso já tem pronto no SCCM 2007, você pode chegar ao ponto de gerar um relatório de todas as maquinas em que o page file não estão do drive D sendo que deveria! Ou um relatório de todas as estações que não tem o Office 2003 com SP 2 e Windows XP SP 2 que seria o padrão da sua imagem.