1- https://blogs.technet.microsoft.com/canitpro/2015/02/10/step-by-step-migrating-windows-server-2003-fsmo-roles-to-windows-server-2012-r2/
2 - certifique-se de que ambos servidores são catalagos global e que o DNS está funcionando corretamente.
2- use o dcdiag para analisar a saude geral do dominio. Ex: dcdiag /e /v /q
3 - antes de formatar, desligue o servidor por alguns dias para se certificar que não restou nenhuma dependencia. Apos alguns dias, quando se sentir seguro de que tudo está bem, de que fez backup de tudo que é necessario, formate-o.