Amigo, essa é sua unica maquina de domínio? tem algum outro server que nao foi afetado?
se tiver uma solução é tirar ela como controlador de domínio, formatar e continuar a trabalhar.
se não tiver outra maquina, existe algum backup?
fica difícil ajudar sem um panorama geral.
mas no geral se você quiser "começar do zero", você vai ter que reconstruir a arvore sysvol.
da uma olhada nesse artigo e diga se ajudou: https://mvrosait.wordpress.com/2012/04/18/como-reconstruir-a-arvore-sysvol-e-seu-conteudo-em-um-dominio/