Olá Felipe,
Não consegui entender essa parte de virtualização que você está querendo explicar. O ambiente para o RDS é muito simples. Vou te falar o modo correto que deveria estar o seu cenário.
- Maquina física com Active Directory;
- Máquina virtualizada com as função RDS, licenciamento e host de sessão (Apenas membro de domínio)
Seguindo esse desenho, você não encontrará problema na instalação e licenciamento, pois é bem simples.
Não sei como está instalado em seu ambiente atual, mas se estiver com o RDS instalado na máquina que está o seu controlador de domínio, terá diversos problemas.
Esse é um artigo meu no 2016 Server, que também serve para o 2012:
https://social.technet.microsoft.com/wiki/pt-br/contents/articles/35740.instalando-e-configurando-remote-desktop-service-windows-server-2016.aspx
Coloco o artigo de instalação, pois pode ser que algo na implantação foi feita de forma incorreta.
Qualquer coisa, desenhe o seu ambiente que te ajudo.
Vinicius Mozart || MVP - Cloud and Datacenter Management || vinicius.mozart@terra.com.br || http://www.wenz.com.br || Skype:vinicius.mozart || www.wenzcursos.com.br
