Fabio,
Bom a diferença de um com outro é que o Sharepoint ele é uttilizado para criação de Bibliotecas, sites Collections, Intranets.
O OneDrive for Business é um client na qual voce consegue sincronizar suas bibliotecas do Sharepoint Localmente em seu computador.
Abaixo segue um passo a passo que mostra esta Sincronização.
http://office.microsoft.com/pt-br/support/sincronizar-bibliotecas-de-sites-do-onedrive-for-business-ou-do-sharepoint-com-seu-computador-HA102832401.aspx
Espero ter ajudado.
Obrigado.
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Jefferson Castilho – MCT | MS | MCTIP | MCTS | MCPS | MPN