Não via nenhuma documentação suportando isso até o momento.
Também não há nenhuma discussão sobre isso no Fórum Oficial de PowerBI, é o caso de você postar algo lá.
http://community.powerbi.com/t5/forums/searchpage/tab/message?q=SQL+Server+Always+Encrypted
A Microsoft tem trabalhado rápido para atender sugestões de melhorias, eu mesmo, já tive uma atendida quando votei em uma sugestão de outro analista.
Vithor da Silva e Silva | SQL Server Consultant and Trainer | vithor@vssti.com.br | Blog: http://www.vssti.com.br/blog ** Por favor, lembre-se de “Marcar como Resposta” as respostas que resolveram o seu problema. **
