Primeiro voce precisa avaliar quais os erros de replicacao estao ocorrendo, o restore de System state nao pode trazer problemas ele é a solucao de um AD corrompido.
Que tipos de replicacao esta com problemas, pode nos enviar o output dos comandos, repadmin, dcdiag? ou as evidencias que possui do problema de replicacao.
Qual o impacto ja causado no exchange?