Olá Rodrigo,
Infelizmente não existe upgrade in-place para mudança de arquitetura. Só fazendo uma nova instalação mesmo. Quanto aos serviços, para cada serviço que você falou, existe sim como exportar e importar,
mas o procedimento é diferente para cada um deles. Não conheço uma forma de levar tudo, do jeito que você está falando.
Para o AD, você vai ter que fazer o backup do System State, para o DHCP, via netsh você faz um export da sua base de leases, para o perfil dos usuários, uma opção é usar o Windows Easy Transfer se for pouca gente,
se for muita gente, pode usar o USMT (perfil local). Pastas e permissões você pode recuperar através do backup, mas os compartilhamentos vão precisar ser refeitos.
O que você vai fazer não é simplesmente mover tudo de um lugar para outro, certifique-se de tirar todas as dúvidas de como exportar/importar antes de partir para formatar a máquina.
Espero ter ajudado...
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