Речь идет о двух DNS записях для пула, а не для самого сервера (хоста). Вы ведь устанавливали Enterprise Edition? Создавали Consolidated Pool? В процессе установки ему имя присваивали? Это имя должно было отличаться от имени самого сервера, вот для него-то в DNS и есть почему-то две записи.
В конфигурации сервера всегда можно посмотреть, какой именно DNS сервер он использует для запросов - там и надо проверять. А то еще, может быть, Вы баловались с hosts файлом...