Utilizando una versión antigua de Ajax puede que no sea compatible con Internet Explorer 9.
Ej: problema con ventanas emergentes
Adicione la línea de abajo en una Master Page por ejemplo, esto debe solucionar el problema
<%@ Master Language="VB" CodeFile="MasterPage.master.vb" Inherits="MasterPage" %>
<
meta
http-equiv
=
"X-UA-Compatible"
content
"IE=100"
>
<!-- IE9 mode -->
<%@ Register Assembly="AjaxControlToolkit" Namespace="AjaxControlToolkit" TagPrefix="asp" %>
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